专业院校分校章程的有效性是一个涉及法律、教育管理和学校治理等多方面的复杂问题。一般来说，专业院校的分校章程必须符合相关法律法规的要求并经过相关主管部门的批准，才能具有法律效力。

首先，专业院校的分校章程必须符合国家和地方相关法律法规的规定。包括教育法、学校法、高等教育法等教育相关法律，以及公司法、劳动法等与学校管理相关的法律。分校章程需要明确学校的性质、管理架构、教学管理制度、师资力量、招生培养、财务管理等方面的内容，并且不得违反法律法规的规定。

其次，专业院校的分校章程还需经过相关主管部门的批准。在中国，教育部门和地方教育行政部门会对专业院校的分校章程进行审查和批准，确保其符合法律法规并有利于教育教学工作的开展。只有经过相关主管部门批准的分校章程，才具有法律效力。

最后，专业院校的分校章程有效性还需要考虑学校治理结构。分校章程需要明确学校的组织架构、决策程序、权责分工等内容，确保学校能够合理有效地开展教育教学工作，并保障师生权益。

综上所述，专业院校的分校章程是否有效取决于其是否符合法律法规的规定并经过相关主管部门的批准，同时还需要考虑学校的治理结构是否合理规范。只有在这些条件都得到满足的情况下，分校章程才具有法律效力。