合并协议是指两个或多个合同的内容被整合到一个单独的文件中。要判断合并协议是否有效，需要考虑以下几个方面：

1. 合并协议的意图：合并协议必须清楚地表明各个合同的内容将被整合到一个文件中。合并协议的起草应当表明双方的意愿，并且在合并协议中应明确表示各个合同的整合。

2. 合并协议的签署：除非另有规定，合并协议必须得到各方的书面同意并签署。签署合并协议时，应当确保各方都对合并协议的条款有充分的了解，并且同意整合各个合同的内容。

3. 合并协议的合法性：合并协议中所包含的各个合同内容本身必须是合法的，并且不应违反任何法律或合同规定。只有在各合同内容都是合法的情况下，合并协议才会被视为有效。

4. 合并协议的生效日期：合并协议应当明确规定各个合同的生效日期，以确保各方在合并后对合同内容的权利和义务清晰明确。

5. 合并协议的规范性：合并协议应当清晰明确地规定各合同内容的整合方式和具体条款，以确保各方在合并后对合同内容的权利和义务清晰明确。

总之，判断合并协议是否有效，需要综合考虑合并协议的意图、签署、合法性、生效日期和规范性等多个方面的因素。合并协议如果符合法律规定并且各方双方都同意和签署，则可以认为是有效的。